加一个条件判断，遍历的行数小于页面上可见行时重新编号

var len=$(".x-table:last tr:visible").length;
$(".x-table:last tr:visible").each(function(i){
     if(i<len){
     	$(this).find("td:first").text(i+1);
     	}
})

参考扩展后排序重新编号-https://help.fanruan.com/finereport/doc-view-2358.html

方法三，js代码如下，最后一行不排序，那就左后一个不判断

$(function(){
     var len=$('.x-table tr').length;
     for(var i=1;i<len-1;i++){
//table中的行数是从0开始算的，下面代码意思是第二行第一个单元格编号是1
     $('.x-table tr:eq('+i+') td:first').text(i);
     }
})