直接join 学生基础信息表就行了

但是你的体温报告表没有主键就比较乱了，只能通过单位、班级和姓名来对应，还不一定准

select 
a.单位,
a.班级,
报告日期,
时段, 
sum(case when 体温<37.3 then 1 else 0 end) 正常人数,
sum(case when 体温>=37.3 then 1 else 0 end) 异常人数,
CASE WHEN CHARINDEX(健康状况,'健康')>0 THEN '健康' ELSE '异常'  END  AS 健康状况 ,
count(1) 人数 
from dbo.学生体温报告 a
join dbo.学生基础信息表 b on a.单位=b.学校 and a.班级=b.年级+cast(b.班级 as varchar)+'班' and a.姓名=b.姓名
where 报告日期 between '${开始时间}' and '${结束时间}' 
${if(len(姓名)==0,""," and a.姓名 like '%"+姓名+"%'")}
${if(len(班级)==0,""," and a.班级 like '%"+班级+"%'")}
${if(len(单位)==0,""," and a.单位 like '%"+单位+"%'")}
group by a.单位,a.班级,时段,报告日期,
CASE WHEN CHARINDEX(健康状况,'健康')>0 THEN '健康' ELSE '异常'  END
order by 报告日期 desc,a.班级 desc

select 
a.单位,
a.班级,
a.报告日期,
a.时段, 
sum(case when a.体温<37.3 then 1 else 0 end) 正常人数,
sum(case when a.体温>=37.3 then 1 else 0 end) 异常人数,
CASE WHEN CHARINDEX(a.健康状况,'健康')>0 THEN '健康' ELSE '异常'  END  AS 健康状况 ,
count(1) 人数 
from dbo.学生体温报告 a left join dbo.学生基础信息表 b 
on a.学生 = b.学生
where 1 = 1 
and b.学生 is not null  -- 重点：排除不在“学生基础信息表”里的学生
and  a.报告日期 between '${开始时间}' and '${结束时间}' 
${if(len(姓名)==0,""," and a.姓名 like '%"+姓名+"%'")}
${if(len(班级)==0,""," and a.班级 like '%"+班级+"%'")}
${if(len(单位)==0,""," and a.单位 like '%"+单位+"%'")}
group by a.单位,a.班级,a.时段,a.报告日期,
CASE WHEN CHARINDEX(a.健康状况,'健康')>0 THEN '健康' ELSE '异常'  END
order by a.报告日期 desc,a.班级 desc